Снимка ВМА

Роден е на 20 август 1964 г. в Дупница. През 1990 г. завършва медицина в Медицинския университет в София. От 1989 г. е офицер в българската армия.  От 1991 г. до 1993 г. началник на медицинската служба към поделение ІV километър − Генерален Щаб. През 1996 г. завършва „обща хирургия“. Между 1997 и 2002 г. е асистент в Клиниката по съдова хирургия на ВМА (КСХ-ВМА). От 2000 до 2003 г. е старши асистент в Клиниката по обща хирургия (КОХ-ВМА). През 2005 г. специализира „Военна хирургия“ и същата година става докторант. Завършва през 2011 г., а от 2012 г. е доцент. През 2014 г. става началник на катедрата по хирургия във ВМА. Същата година става заместник-началник на академията. От 2015 г. е професор по хирургия.

От 2017 г. е временно изпълняващ длъжността началник на Военномедицинска академия. На 7 февруари 2018 г. с указ на президента на Република България и със заповед № КВ-65/12 февруари 2018 г. на министъра на отбраната е назначен за началник на ВМА и главен лекар на въоръжените сили на Република България. С Указ № 96 от 30 април 2019 г. на Президента на България е удостоен с висше офицерско звание генерал-майор, считано от 6 май 2019 г. На 24 февруари 2020 г. е назначен за ръководител на Националния оперативен щаб за борба с коронавируса в България.

Мутафчийски е семеен – съпругата му Елена е психиатър и имат синове-близнаци – Марк и Александър (родени 1994 г.).

Двамата са завършили във Великобритания: Марк – Икономика, а Александър – Право.