Янаки Стоилов е роден на 8 септември 1958 г. във Велико Търново.
Завършва право, доктор по право в Софийския университет „Св. Кл. Охридски“.
1990-1991 става депутат във 7-ото Велико народно събрание.
1997 – депутат в 36-ото НС.
2001 – народен представител в 38-от НС.
2005 – народен представител в 40-то НС.
През 2009 г. е избран за народен представител в 41-то Народно събрание от „Коалиция за България“.
На парламентарните избори през 2013 година е избран за депутат и в 42-рото Народно събрание.
На предсрочните парламентарни избори през октомври 2014 година е избран за депутат и в 43-тото Народно събрание.
Янаки Стоилов е номинацията на втората по големина парламентарна група за зам.-председател на парламента.
